La disciplina dettata dal Regolamento di contabilità del CNR (Decreto del Presidente del CNR del 4 maggio 2005 Prot. n. 0025033) ha introdotto accanto alla contabilità finanziaria, un sistema di contabilità economico- patrimoniale ed analitica. Il CNR, pur mantenendo un sistema di contabilità pubblica mediante la predisposizione di un bilancio di previsione redatto in termini di competenza ed ispirato ad obiettivi programmatici, formula tanti bilanci gestionali di cassa, per ogni centro di spesa, che rendono operante il riconoscimento dell'autonomia contabile e di bilancio alle strutture scientifiche ed amministrative del CNR.

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